学科建设系统是国科大网络中心应学位办要求建设的系统，主要为各研究所和院系进行培养点的申报和评估、学位办进行学科专业的评估和公示等工作提供了电子平台。该系统在用户界面和功能菜单上的的设置与实际学科建设工作进程保持一致，减少了研究所管理干部的重复劳动和繁琐的数据上报工作。 本系统首先由学位办管理人员开通申报或者评审批次，然后培养单位进行填报和提交，之后由学位办组织评审和公示结果。